PSIM Yogyakarta berada satu grup dengan juara ISC B 2016, PSCS Cilacap. Mereka tergabung di grup H bersama Persipur Purwodadi dan Persewangi Banyuwangi.
PSIM memastikan satu tiket babak playoff setelah dipertandingan terakhir mampu menahan seri tuan rumah Persepam Madura Utama. Di grup H pertandingan akan dilaksanakan pada tanggal 8 - 17 Oktober 2017 mendatang dengan sistem home turnamen. Stadion Kanjuruhan di Malang akan menjadi tempat pertarungan ke empat tim tersebut.
Laskar Mataram menjadi satu satunya klub DIY yang bertarung di babak playoff Liga 2. Saudara mereka PSS Sleman berhasil lolos ke babak 16 besar, sedangkan Persiba Bantul harus terdegradasi ke Liga 3.
PSIM akan memperebutkan 5 jatah tiket untuk bertahan di Liga 2 musim depan. Hanya akan ada 4 juara grup dan 1 runner up terbaik yang bakal tetap bertahan di Liga 2 musim depan.
Deretan kesebelasan yang berhasil bertahan di Liga 2 pada musim depan nantinya akan bersanding dengan tiga klub degradasi dari Liga 1 serta tiga klub promosi Liga 3. Mereka akan melengkapi 13 dari 16 tim Liga 2 yang telah lolos ke babak 16 besar, untuk berkompetisi di Liga 2 nantinya.
Musim depan, kompetisi kasta kedua Liga Indonesia itu hanya akan dihuni oleh 24 tim. Berkurang jauh dari kondisi saat ini yang diikuti 59 peserta.